自2008年1月1日起，統一適用于所有內外資企業的新企業所得稅法開始實施。與原來的內外資企業所得稅法相比，新的企業所得稅法在納稅人、應納稅所得額的計算、應納稅額的計算等方面都發生了較大的變化。其中，根據原內資企業所得稅條例，獨立核算的不具有法人地位的分公司就是一個獨立納稅人，可以根據自己的收入、成本、費用等，計算并在當地繳納所得稅。根據原外資企業所得稅法，外商投資企業的分支機構，雖然由總機構統一繳納所得稅，但是，各分支機構需要計算各自的應納稅所得和應納稅額。而根據新的企業所得稅法，依據中國法律注冊成立的企業，不具有法人地位的分公司不是企業所得稅的納稅人。也就是說，以前因獨立核算而具有納稅人資格的分公司在新法下將不再具有納稅人資格。那么，分公司應在何地納稅就成了一個需要迫切解決的問題，因為這可能導致不同地方的稅收利益關系發生相應變化，跨省設立分支機構的企業在這個問題上更為突出。為解決跨省市設立分支機構的企業應納稅所得額的計算、繳納和分享問題，財政部、國家稅務總局、中國人民銀行聯合發布的《跨省市總分機構企業所得稅分配及預算管理暫行辦法》（財預[2008]10號，以下簡稱10號文）明確規定，跨省市設立分支機構的企業所得稅，按照統一規范、兼顧總機構和分支機構所在地利益的原則，實行“統一計算、分級管理、就地預繳、匯總清算、財政調庫”的辦法。

　　一、主要內容解析
　　1、應納稅所得額和應納稅額的計算
　　“統一計算”就是居民企業應統一計算包括各個不具有法人資格營業機構在內的企業全部應納稅所得額和應納稅額。也就是說，跨省市設立分支機構的企業，應匯集各分支機構的收入、成本、費用等，統一計算應納稅所得額和應納稅額，這也符合新所得稅法實施條例第125條關于“企業匯總計算并繳納企業所得稅時，應當統一核算應納稅所得額”的規定。

　　但是，有些企業的總機構和分支機構可能適用不同的稅率，如北京某高新技術企業適用15%的稅率，其設在上海的一家專門從事貿易活動的分公司可能是25%的稅率。針對這種情況，10號文規定，總機構和分支機構適用稅率不一致的，應分別計算應納稅所得額和應納稅額，分別按適用稅率繳納。

　　2、應納稅額的繳納
　　為兼顧總機構和分支機構所在地的利益關系，10號文規定，總機構和分支機構應分別在當地按月或按季預繳稅款，即“就地預繳”。

　　具體方法是：總機構根據企業本期累計實際經營成果，統一計算企業實際利潤額、應納稅額。將總機構計算的應納稅額分成相等的兩部分，50%由總機構繳納，另外的50%由分支機構繳納。如果一個總機構下設多家分支機構，則再由各分支機構按照一定的比例計算自己應在當地繳納的稅款，各分支機構的分享比例按照各自的經營收入，職工工資和資產總額三個因素和0.35、0.35、0.3的權重計算得出。具體的計算公式如下：
　　各分支機構應分攤預繳額=所有分支機構應分攤的預繳總額×該分支機構分攤比例

　　所有分支機構應分攤的預繳總額=統一計算的企業當期應納稅額×50%

　　該分支機構分攤比例=（該分支機構經營收入/各分支機構經營收入總額）×0.35+（該分支機構職工工資/各分支機構職工工資總額）×0.35+（該分支機構資產總額/各分支機構資產總額之和）×0.30

　　在此需要注意兩個問題：一是這里的資產不包括無形資產，因為無形資產不可能屬于哪個分支機構。二是雖然根據新企業所得稅法第128條的規定，長沙公司注銷，納稅人按照月度或季度的實際利潤額預繳有困難的，可以按照上一納稅年度應納稅所得額的月度或者季度平均額預繳，但這里提到的總機構的應納稅額是根據實際經營成果計算出來，而不是根據上年度應納稅所得額的一定比例計算。

　　3、應納稅額的分享
　　“財政調庫”就是在堅持目前所得稅由中央和地方按照60：40的比例分享的前提下，對由總機構繳納的部分稅款，不是在中央與總機構所在地之間分配，而是由財政部在全國各地之間進行分配。目前的所得稅是共享稅，中央占60%，企業所在地的地方占40%.10號文在中央與地方共享的問題上，雖然沒有改變目前60：40的分享比例，但是卻將總機構繳納的部分稅款變成全國各地方共同分享。具體辦法如下：
　　總機構在其所在地繳納全部稅額的50%，但是這50%又分成相等的兩部分：應納稅總額的25%就地辦理繳庫，所繳稅款由中央與總機構所在地按照60：40分享；應納稅總額另外的25%由總機構全額繳入中央國庫，所繳納稅款的60%為中央收入，40%由財政部按照2004～2006年各省市三年實際分享企業所得稅占地方分享總額的比例定期向各省市分配。