1998年12月14日國(guó)務(wù)院在總結(jié)各地醫(yī)療保險(xiǎn)制度改革試點(diǎn)經(jīng)驗(yàn)的基礎(chǔ)上，長(zhǎng)沙公司注銷，下發(fā)了《關(guān)于建立城鎮(zhèn)職工基本醫(yī)療保險(xiǎn)制度的決定》(國(guó)發(fā)[1998]44號(hào))，在全國(guó)范圍內(nèi)建立城鎮(zhèn)職工基本醫(yī)療保險(xiǎn)制度工作，進(jìn)行城鎮(zhèn)職工醫(yī)療保險(xiǎn)制度改革，于1999年初開(kāi)始啟動(dòng)，1999年底基本完成。為配合改革，財(cái)政部、國(guó)家稅務(wù)總局先后多次就醫(yī)療保險(xiǎn)費(fèi)列支制定了相關(guān)政策。而我們?cè)趯?shí)際操作中發(fā)現(xiàn)，由于會(huì)計(jì)與稅收的不同，相對(duì)造成了納稅人繳納的醫(yī)療保險(xiǎn)費(fèi)因會(huì)計(jì)處理而帶來(lái)的稅收負(fù)擔(dān)，普遍反映是納稅人列入“應(yīng)付褔?yán)M(fèi)”的醫(yī)療保險(xiǎn)費(fèi)，由于稅收政策不明確導(dǎo)致稅務(wù)機(jī)關(guān)在計(jì)算繳納所得稅時(shí)不予考慮，特別是國(guó)家稅務(wù)總局一直以來(lái)未對(duì)1998年制定的《企業(yè)所得稅申報(bào)表》涉及醫(yī)療保險(xiǎn)費(fèi)扣除作具體說(shuō)明和修正，產(chǎn)生了征納之間不可化解的矛盾。

　　隨著企業(yè)所得稅政策的不斷完善和企業(yè)財(cái)務(wù)會(huì)計(jì)制度的調(diào)整變化，現(xiàn)行《企業(yè)所得稅納稅申報(bào)表》已不能全面體現(xiàn)和貫徹企業(yè)所得稅政策及征管的要求。為貫徹落實(shí)全國(guó)所得稅管理工作會(huì)議精神，按照企業(yè)所得稅科學(xué)化、精細(xì)化管理的要求，配合匯算清繳改革，進(jìn)一步規(guī)范企業(yè)所得稅納稅申報(bào)，2006年4月18日總局印發(fā)了《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于修訂企業(yè)所得稅納稅申報(bào)表的通知》（國(guó)稅發(fā)[2006]56號(hào)），對(duì)企業(yè)所得稅納稅申報(bào)表重新予以設(shè)計(jì)。通知附件1、《企業(yè)所得稅年度納稅申報(bào)表》及填表說(shuō)明中附表五關(guān)于《納稅調(diào)整減少項(xiàng)目明細(xì)表》填報(bào)說(shuō)明第六條“有關(guān)項(xiàng)目填報(bào)說(shuō)明”4項(xiàng)規(guī)定：“第4行、第5行‘在應(yīng)付福利費(fèi)中列支的基本醫(yī)療保險(xiǎn)、補(bǔ)充醫(yī)療保險(xiǎn)’：填報(bào)本納稅年度在應(yīng)付福利費(fèi)中實(shí)際列支的符合稅收規(guī)定標(biāo)準(zhǔn)的基本醫(yī)療保險(xiǎn)、補(bǔ)充醫(yī)療保險(xiǎn)（超過(guò)稅收規(guī)定標(biāo)準(zhǔn)部分不得納稅調(diào)減）”。

　　新文件實(shí)施前的會(huì)計(jì)與稅務(wù)處理：

　　1、會(huì)計(jì)處理

　　一般而言，納稅人繳納的醫(yī)療保險(xiǎn)費(fèi)應(yīng)按財(cái)務(wù)制度規(guī)定作相應(yīng)的會(huì)計(jì)處理。《財(cái)政部關(guān)于加強(qiáng)職工基本醫(yī)療保險(xiǎn)財(cái)務(wù)管理工作的通知》（財(cái)社字[1999]158號(hào)）對(duì)職工醫(yī)療保險(xiǎn)支出的列支渠道做了嚴(yán)格限定：

　　（一）單位繳納的職工基本醫(yī)療保險(xiǎn)費(fèi)：行政機(jī)關(guān)列“經(jīng)常性支出”的“社會(huì)保障費(fèi)”支出；事業(yè)單位列“事業(yè)支出”的“社會(huì)保障費(fèi)”（專職從事經(jīng)營(yíng)活動(dòng)的職工繳費(fèi)列“經(jīng)營(yíng)支出”）；企業(yè)在職職工列支“應(yīng)付福利費(fèi)”，企業(yè)離退休人員列支“勞動(dòng)保險(xiǎn)費(fèi)”。

　　（二）企業(yè)職工補(bǔ)充醫(yī)療保險(xiǎn)費(fèi)：國(guó)家批準(zhǔn)建立補(bǔ)充醫(yī)療保險(xiǎn)的特定行業(yè)，其補(bǔ)充醫(yī)療保險(xiǎn)費(fèi)在職工工資總額4%以內(nèi)部分，列支企業(yè)“應(yīng)付福利費(fèi)”，“應(yīng)付福利費(fèi)”不足列支部分，經(jīng)同級(jí)財(cái)政部門核準(zhǔn)后可以列入成本。財(cái)政部門應(yīng)根據(jù)企業(yè)效益情況認(rèn)真審核，從嚴(yán)把關(guān)。并且，《財(cái)政部關(guān)于企業(yè)為職工購(gòu)買保險(xiǎn)有關(guān)財(cái)務(wù)處理問(wèn)題的通知》（財(cái)企〔2003〕61號(hào)）規(guī)定，各類型企業(yè)按照《中華人民共和國(guó)勞動(dòng)法》以及國(guó)家有關(guān)規(guī)定參加基本養(yǎng)老保險(xiǎn)、失業(yè)保險(xiǎn)、基本醫(yī)療保險(xiǎn)等社會(huì)保險(xiǎn)統(tǒng)籌，為職工繳納的除基本醫(yī)療保險(xiǎn)費(fèi)以外的社會(huì)保險(xiǎn)費(fèi)，作為勞動(dòng)保險(xiǎn)費(fèi)列入成本（費(fèi)用），為職工繳納的基本醫(yī)療保險(xiǎn)費(fèi)，從應(yīng)付福利費(fèi)中列支；由職工繳納的社會(huì)保險(xiǎn)費(fèi)從職工個(gè)人的應(yīng)發(fā)工資中扣繳。

　　2、稅務(wù)處理

　　追溯醫(yī)療保險(xiǎn)費(fèi)稅前扣除文件，《國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)<企業(yè)所得稅稅前扣除辦法>的通知》（國(guó)稅發(fā)[2000]84號(hào)）第四十九條曾規(guī)定：納稅人為全體雇員按國(guó)家規(guī)定向稅務(wù)機(jī)關(guān)、勞動(dòng)社會(huì)保障部門或其指定機(jī)構(gòu)繳納的基本養(yǎng)老保險(xiǎn)費(fèi)、基本醫(yī)療保險(xiǎn)費(fèi)、基本失業(yè)保險(xiǎn)費(fèi)，按經(jīng)省級(jí)稅務(wù)機(jī)關(guān)確認(rèn)的標(biāo)準(zhǔn)交納的殘疾人就業(yè)保障金，按國(guó)家規(guī)定為特殊工種職工支付的法定人身安全保險(xiǎn)，可以扣除。

　　此外，根據(jù)國(guó)務(wù)院《關(guān)于印發(fā)完善城鎮(zhèn)社會(huì)保障體系試點(diǎn)方案的通知》(國(guó)發(fā)[2000]42號(hào))的精神，《財(cái)政部國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于完善城鎮(zhèn)社會(huì)保障體系試點(diǎn)中有關(guān)所得稅政策問(wèn)題的通知》（財(cái)稅[2001]9號(hào)）部分經(jīng)濟(jì)效益好的企業(yè)為職工建立的補(bǔ)充養(yǎng)老保險(xiǎn)，繳納額在工資總額4%以內(nèi)的部分，以及企業(yè)為職工建立的補(bǔ)充醫(yī)療保險(xiǎn)，提取額在工資總額4%以內(nèi)的部分，準(zhǔn)予在繳納企業(yè)所得稅前全額扣除（適用于在遼寧全省以及其他省、自治區(qū)、直轄市按《通知》規(guī)定確定的試點(diǎn)地區(qū)繳納企業(yè)所得稅和個(gè)人所得稅的納稅人，自各地區(qū)實(shí)施之日起執(zhí)行）。非試點(diǎn)地區(qū)企業(yè)為職工建立補(bǔ)充醫(yī)療保險(xiǎn)，繼續(xù)執(zhí)行國(guó)務(wù)院《關(guān)于建立城鎮(zhèn)職工基本醫(yī)療保險(xiǎn)制度的決定》確定的標(biāo)準(zhǔn)，提取額在工資總額4%以內(nèi)的部分，從職工福利費(fèi)中列支，福利費(fèi)不足列支的部分，經(jīng)同級(jí)財(cái)政部門核準(zhǔn)后列入成本，準(zhǔn)予在繳納企業(yè)所得稅前全額扣除。