法律依據：
1、《貸款通則》第六十一條規定“各級行政部門和企事業單位、供銷合作社等合作經濟組織、農村合作基金會和其他基金會，不得經營存貸款等金融業務。企業之間不得違反國家規定辦理借貸或者變相借貸融資業務。”

第七十三條規定“行政部門、企事業單位、股份合作經濟組織、供銷合作社、農村合作基金會和其他基金會擅自發放貸款的；企業之間擅自辦理借貸或者變相借貸的，由中國人民銀行對出借方按違規收入處以l倍以上至5倍以下罰款，并由中國人民銀行予以取締。”

2、《最高人民法院關于對企業借貸合同借款方逾期不歸還借款的應如何處理問題的批復》規定：“企業借貸合同違反有關金融法規，屬無效合同。”“對自雙方當事人約定的還款期滿之日起，至法院判決確定借款人返還本金期滿期間內的利息，應當收繳，該利息按借貸雙方原約定的利率計算，如果雙方當事人對借款利息未約定，按同期銀行貸款利率計算。”

3、《最高人民法院關于審理聯營合同糾紛案件若干問題的解答》規定“企業法人、事業法人作為聯營一方向聯營體投資，但不參加共同經營，也不承擔聯營的風險責任，不論盈虧均按期收回本息，或者按期收取固定利潤的，是明為聯營，實為借貸，違反了有關金融法規，應當確認合同無效。除本金可以返還外，對出資方已經取得或者約定取得的利息應予收繳，對另一方則應處以相當于銀行利息的罰款。”

問題探討：
1、從以上法律規定可知，企業之間借款產生的利息收入屬于非法所得，應予收繳，因此不存在是否征收營業稅的問題；但按照稅法規定，有需要按照利息收入繳納營業稅：國家稅務總局2008年6月10的解答“企業之間不通過銀行借款（民間借貸）產生的利息收入，按照《國家稅務總局營業稅問題解答（之一） 》（國稅函發[1995]156號）第十條規定，“《營業稅稅目注釋》規定，貸款屬于‘金融保險業’稅目的征收范圍，而貸款是指將資金貸與他人使用的行為。根據這一規定，不論金融機構還是其他單位，只要是發生將資金貸與他人使用的行為，均應視為發生貸款行為，按‘金融保險業’稅目征收營業稅。”據此，企業的民間借貸產生的利息收入，應按利息收入總額繳納營業稅，稅率為5%”。

2、由于借款合同在法律上屬于無效合同，因此因借款合同產生的利息支出在法律上也是無效的，但稅法規定，又可以在企業所得稅前扣除：《中華人民共和國企業所得稅法實施條例》第三十八條規定“企業在生產經營活動中發生的下列利息支出，準予扣除。…非金融企業向非金融企業借款的利息支出，不超過按照金融企業同期同類貸款利率計算的數額的部分。”

針對上述法律存在之問題，歡迎大家討論指正！

是否屬于非法收入應該由法院來認定，稅務機關無權認定收入是否非法，因此在法院沒有認定為非法收入前，稅務機關征稅是沒問題的，一旦法院認定其為非法收入并予以沒收，企業可以法院的判決書向稅務機關申請退稅，這樣處理才是符合法律程序。
這個問題正是稅法與法律的一個實質性差異，法律注重形式，稅法注重實質。
我去年在撰寫《個人所得稅納稅籌劃》一書的時候研究了這個問題，所以在書中也專門探討了這個問題。譬如，個人所得稅法的第一句話：“在中國境內有住所，長沙代理記賬，或者無住所而在境內居住滿一年的個人，從中國境內和境外取得的所得，依照本法規定繳納個人所得稅”，請注意，規定必須是合法收入了么？
如果你仔細研究，此類問題多著呢，稅法處處貫穿的是“實質課稅原則”，一句話說白了，稅法就是規定有收入要交稅，而不論該收入是否合法。

看來答案已經很明顯了，先不管是否違法，交了5%的營業稅就行，這種發票我以前都是到稅務局直接代開的，代開就說明稅務局認可了這種行為，以后基本不會找你麻煩。