2007年8月1日，財政部、國家稅務總局發布了國稅發[2007]94號文件，規定自2007年1月1日起，對機關服務中心為機關內部提供的后勤保障服務所取得的收入，恢復征收營業稅、城市維護建設稅、教育費附加和企業所得稅。自此，自1999年以來幾經反復針對機關服務中心的稅收優惠政策正式取消。今后，各地機關服務中心不但不能享受相關稅收優惠，而且很有可能面臨稅務機關的全面清查。自1999年以來，國家為促進國務院各部門機關后勤體制的改革，陸續出臺了一系列對機關服務中心的稅收優惠政策，這些政策主要有：一、1999年10月22日，為了促進國務院各部門機關后勤體制的改革，財政部、國家稅務總局頒布了《財政部、國家稅務總局關于國務院各部門機關服務中心有關稅收政策問題的通知》 （ 財稅字[1999]43號）

　　該文件規定，自1999年10月22日起至2003年底，對機關服務中心為機關內部提供的后勤保障服務所取得的收入，暫免征收營業稅、城市維護建設稅、教育費附加、企業所得稅；同時對于機關服務中心以安分流人員為主開辦的經濟實體從事經營、服務活動，也可享受國家統一規定的有關稅收優惠政策。

　　但對機關服務中心為機關以外提供服務取得的收入，應依照國家統一規定納稅。

　　二、2000年，國稅發[2000]153號對此政策又做出進一步的明確規定：（一）對享受稅收優惠政策的機關服務中心范圍進行了明確，即：經中央機構編制委員會辦公室批準，后勤體制改革后的國務院各部委、各直屬機構的機關服務中心。并要求機關服務中心必須實行獨立經濟核算并具有事業法人或企業法人資格，按法規辦理稅務登記。

　　（二）對于機關服務中心的范圍進行了解釋，即機關服務中心應為機關辦公和職工生活提供后勤服務的非獨立核算機關服務單位，包括：機關食堂、車隊、醫務室、幼兒園、理發室、洗衣房、洗浴室、副食品基地（綠化基地）等；機關內部后勤保障服務是指：上述機關服務中心為國家財政金額撥付行政辦公經費的國務院各部委、各直屬機構機關工作需要而提供的各類勞務與技術性服務。

　　（三）機關服務中心應分別核算為機關內部提供的后勤保障服務所取得的收入和為機關以外提供服務取得的收入。不能分別核算免稅收入和應稅收入的單位，不能享受稅收優惠政策。

　　（四）機關服務中心所屬的，國務院機關事務管理局行業歸口管理的賓館招待所，由國務院機關事務管理局核準的會議經費，在2003年年底之前暫免征收營業稅、城市維護建設稅、教育費附加。

　　（五）機關服務中心以安置分流人員為主開辦的經濟實體從事經營、服務活動，可比照《財政部、國家稅務總局關于企業所得稅若干優惠政策的通知》（[94]財稅字第001號）的有關法規，享受國家統一法規的有關稅收優惠政策。

　　三、2001年7月，財稅[2001]122號文件《財政部、國家稅務總局關于中央各部門機關服務中心有關稅收政策問題的通知》將該項優惠政策延長至2005年年底：對機關服務中心為機關內部提供的后勤保障服務所取得的收入，在2005年12月31日之前暫免征收營業稅、城市維護建設稅、教育費附加、企業所得稅；機關服務中心以安置分流人員為主開辦的經濟實體從事經營、服務活動，可享受國家統一法規的有關稅收優惠政策；同時擴充了該文件的執行范圍，即全國人大常委會和全國政協常委會所屬機構、中央黨校、全國總工會、共青團中央、全國婦聯、全國臺聯、中國記協以及地方省級黨委、人大、政協等機關后勤體制改革后可比照執行。

　　四、在隨后的2004年又發布了《財政部、國家稅務總局關于延長國務院各部門機關服務中心有關稅收政策執行期限的通知》（ 財稅[2004]42號） ：“對機關服務中心有關營業稅、城市維護建設稅、教育費附加、企業所得稅等稅收征免政策，繼續按照財稅字[1999]43號文件的有關規定執行，執行期限為2004年1月1日至2005年12月31日。”五、2006年，為繼續支持中央和國務院各部門機關后勤管理體制改革工作的順利進行，《財政部、國家稅務總局關于延長中央和國務院各部門機關服務中心有關稅收政策執行期限的通知》 （財稅[2006]109號） 對該政策延長執行期限至2006年底，具體內容為：“對機關服務中心為機關內部提供的后勤保障服務所取得的收入，在2006年年底之前暫免征收企業所得稅、營業稅、城市維護建設稅和教育費附加；對機關服務中心為機關以外提供服務取得的收入，應依照國家統一規定征稅；機關服務中心以安置分流人員為主開辦的經濟實體從事經營、服務活動，可享受國家統一規定的有關稅收優惠政策；全國人大常委會和全國政協所屬機構、中央黨校、全國總工會、共青團中央、全國婦聯、全國臺聯、中國記協以及地方省級黨委、人大、政府、政協等機關后勤體制改革后，可比照上述規定執行。”