高新技術企業認定申請需要提供兩類審計報告：一類是認定期年度審計報告，另一類是專項審計報告——后者對于高新技術企業認定申請具有特殊用途，表明注冊會計師按照審計準則和《工作指引》規定執行高企認定專項審計業務，能夠對申報企業的研究開發費用結構明細表和高新技術產品（服務）收入明細表不存在重大錯報獲取合理保證。

　　當然，我們需要明白：高新技術企業內部控制宗旨和高企認定審計目的截然不同，注冊會計師是對申報企業編制的申報明細表作出評價，并非對企業所有的控制發表審計意見。

　　高新技術企業認定申請需要出具審計或鑒證報告的材料

　　企業近三個會計年度（實際年限不足三年的按實際經營年限）研究開發費用專項審計或鑒證報告,并附研究開發活動說明材料；

　　近一個會計年度高新技術產品（服務）收入專項審計或鑒證報告；

　　經具有資質的中介機構鑒證的企業近三個會計年度的財務會計報告（包括會計報表、會計報表附注和財務情況說明書）。

　　出具高新技術企業認定專項審計報告或鑒證報告的中介機構應具備何資質

　　具備獨立執業資格，成立三年以上，近三年內無不良記錄；承擔認定工作當年的注冊會計師或稅務師人數占職工全年月平均人數的比例不低于30%，全年月平均在職職工人數在20人以上；相關人員應具有良好的職業道德，了解國家科技、經濟及產業政策，熟悉高新技術企業認定工作有關要求。

　　凡是黑名單事務所提供的專項審計報告均無效。建議企業多關注“高新技術企業認定工作網”當中“公示公告”下的“中介機構黑名單”欄目。

　　高新技術企業認定專項報告有哪些類型

　　高新技術企業認定專項審計業務的專項審計報告可以分為無保留意見的審計報告、保留意見的審計報告、否定意見的審計報告和無法表示意見的審計報告。保留意見的專項審計報告、否定意見的專項審計報告和無法表示意見的專項審計報告，統稱為非無保留意見的專項審計報告。

　　根據注冊會計師出具的無保留意見的審計報告是否附加說明段、強調事項段或任何修飾性用語時，可將報告分為標準專項審計報告和非標準專項審計報告。非標準專項審計報告，是指標準專項審計報告以外的其他專項審計報告，包括帶強調事項段的無保留意見的專項審計報告和非無保留意見的專項審計報告。

　　高新技術企業專項審計報告包含哪些要素

　　高新技術企業專項審計報告應當包括下列要素：標題，收件人；引言段；管理層的責任段，注冊會計師的責任段；說明段，審計意見段；編制基礎及使用限制段；注冊會計師的簽名和蓋章；會計師事務所的名稱、地址及蓋章；以及報告日期。

　　引言段、說明段和審計意見段，以及編制基礎及使用限制段是審計報告重要部分。

　　專項審計報告的引言段會說明申報企業的名稱以及具體審計對象，是對研究開發費用或者是高新技術產品（服務）收入明細表進行的審計。

　　說明段會擺出發表審計意見段的理由。涉及出具非無保留意見的專項審計報告時，注冊會計師應當在注冊會計師的責任段之后、審計意見段之前增加說明段，詳細表明導致發表保留意見、否定意見或無法發表意見的所有原因，并在可能的情況下，注冊會計師會指出其對研究開發費用或者高新技術產品（服務）收入明細表的影響程度；該說明段有時也會以“強調事項”形式出現在“審計意見段”之后，反映一些重大不確定性事項，只是增加專項審計報告的信息含量，提高專項審計報告的有用性，不影響發表的審計意見。

　　編制基礎及使用限制段是表明審計報告使用用途的，比如，高新技術企業認定申請用的審計報告，會在這段文字當中明確表明“專項審計報告僅供申報企業申報高新技術企業認定時使用，不得用于其他目的”類似表述。

　　高新技術企業專項審計報告當中涉及高新技術產品（服務）收入部分的具體內容

　　涉及高新技術產品（服務）收入部分的是：申請前一年度企業產品（服務）收入情況表和申請前一年度高新技術產品（服務）收入明細表，編制原則和方法，以及說明。

　　注意：高新技術企業認定必須滿足“最近一個會計年度高新技術產品（服務）收入占企業當年總收入的60%以上。具體表格如下圖所示：