根據《國家稅務總局關于印發<跨地區經營匯總納稅企業所得稅征收管理辦法>的公告》（國家稅務總局公告2012年第57號）、《財政部 國家稅務總局 中國人民銀行關于印發〈跨省市總分機構企業所得稅分配及預算管理辦法〉的通知》（財預〔2012〕40號）、《國家稅務總局關于跨地區經營建筑企業所得稅征收管理問題的通知》（國稅函〔2010〕156號）文件，居民企業在中國境內跨地區（指跨省、自治區、直轄市和計劃單列市，下同）設立不具有法人資格分支機構的，該居民企業為跨地區經營匯總納稅企業（以下簡稱匯總納稅企業），除另有規定外，實行“統一計算、分級管理、就地預繳、匯總清算、財政調庫”的企業所得稅征收管理辦法，主要關注以下要點：

（一）二級分支機構

匯總納稅企業，其總機構和具有主體生產經營職能的二級分支機構，就地分攤繳納企業所得稅。二級分支機構，是指匯總納稅企業依法設立并領取非法人營業執照（登記證書），且總機構對其財務、業務、人員等直接進行統一核算和管理的分支機構。

總機構設立具有主體生產經營職能的部門（非上述定義的二級分支機構），且該部門的營業收入、職工薪酬和資產總額與管理職能部門分開核算的，可將該部門視同一個二級分支機構，按本辦法規定計算分攤并就地繳納企業所得稅；該部門與管理職能部門的營業收入、職工薪酬和資產總額不能分開核算的，該部門不得視同一個二級分支機構，不得按本辦法規定計算分攤并就地繳納企業所得稅。

以下二級分支機構不就地分攤繳納企業所得稅：

1.不具有主體生產經營職能，且在當地不繳納增值稅、營業稅的產品售后服務、內部研發、倉儲等匯總納稅企業內部輔助性的二級分支機構，不就地分攤繳納企業所得稅。

2.上年度認定為小型微利企業的，其二級分支機構不就地分攤繳納企業所得稅。

3.新設立的二級分支機構，設立當年不就地分攤繳納企業所得稅。

4.當年撤銷的二級分支機構，自辦理注銷稅務登記之日所屬企業所得稅預繳期間起，不就地分攤繳納企業所得稅。

5.匯總納稅企業在中國境外設立的不具有法人資格的二級分支機構，不就地分攤繳納企業所得稅。

另外，匯總納稅企業當年由于重組等原因從其他企業取得重組當年之前已存在的二級分支機構，并作為本企業二級分支機構管理的，該二級分支機構不視同當年新設立的二級分支機構，需計算分攤并就地繳納企業所得稅。

匯總納稅企業內就地分攤繳納企業所得稅的總機構、二級分支機構之間，發生合并、分立、管理層級變更等形成的新設或存續的二級分支機構，不視同當年新設立的二級分支機構，需計算分攤并就地繳納企業所得稅。

（二）總分機構分攤稅款的計算

總機構分攤稅款=匯總納稅企業當期應納所得稅額×50％

所有分支機構分攤稅款總額=匯總納稅企業當期應納所得稅額×50％

某分支機構分攤稅款=所有分支機構分攤稅款總額×該分支機構分攤比例

某分支機構分攤比例=（該分支機構營業收入／各分支機構營業收入之和）×0.35+（該分支機構職工薪酬／各分支機構職工薪酬之和）×0.35+（該分支機構資產總額／各分支機構資產總額之和）×0.30。

分支機構營業收入，是指分支機構銷售商品、提供勞務、讓渡資產使用權等日常經營活動實現的全部收入。其中，生產經營企業分支機構營業收入是指生產經營企業分支機構銷售商品、提供勞務、讓渡資產使用權等取得的全部收入。金融企業分支機構營業收入是指金融企業分支機構取得的利息、手續費、傭金等全部收入。保險企業分支機構營業收入是指保險企業分支機構取得的保費等全部收入。

分支機構職工薪酬，是指分支機構為獲得職工提供的服務而給予各種形式的報酬以及其他相關支出。

分支機構資產總額，是指分支機構在經營活動中實際使用的應歸屬于該分支機構的資產合計額。

營業收入、職工薪酬和資產總額，均為分支機構上年度按照國家統一會計制度核算的全年的營業收入、職工薪酬數據和上年度12月31日的資產總額數據。根據《企業會計準則第9號——職工薪酬》，職工薪酬是指企業為獲得職工提供的服務或解除勞動關系而給予的各種形式的報酬或補償。 即職工薪酬包括 “應付職工薪酬” 會計科目下核算的所有項目，不僅指工資薪金，還是包括福利、職工教育經費、工會經費、“五險一金”、辭退補償等在內的所有支出。