為適應鐵路體制改革和鐵路網建設的發展變化，有利于鐵路貨運憑證印花稅的征收和管理，2006年7月12日，國家稅務總局、鐵道部聯合下發了《國家稅務總局鐵道部關于鐵路貨運憑證印花稅若干問題的通知》（國稅發[2006]101號）（以下簡稱“新文件”），對鐵路貨運憑證印花稅的征收和管理的若干問題進行了重新明確。這一文件是在《國家稅務總局鐵道部關于鐵路貨運憑證匯總繳納印花稅問題的聯合通知》（〔89〕國稅地字第094號）全文廢止（以下簡稱“舊文件”）文件的基礎上，依據貨物運輸合同有關印花稅的規定，結合稅收征管實際，做的進一步的修改和補充，增加了文件的嚴密性和可操作性。

　　一、新文件與舊文件相比，幾點新的變化。
　　1、“新文件”對鐵路貨運業務印花稅的納稅人做了具體明確的規定。
　　“新文件”增加了鐵路貨運業務印花稅納稅人的規定，鐵路貨運業務中運費結算憑證載明的承、托運雙方，均為貨運憑證印花稅的納稅人。新文件還對代辦鐵路貨運業務的代辦方做了明確的規定，代辦托運業務的代辦方在向鐵路運輸企業交運貨物并取得運費結算憑證時，應當代托運方繳納印花稅。代辦方與托運方之間辦理的運費結算清單，不繳納印花稅。

　　2、“新文件”對應納稅憑證和計稅依據的規定，更具可操作性。
　　由于“舊文件”在應納稅憑證和計稅依據上只是泛泛的規定，‘鐵路貨運的應納稅憑證為運單所對應的鐵路貨票。貨票中承運方的報告聯作為計算匯繳和代扣匯繳的原始憑證；托運方的報銷聯作為繳納印花稅的完稅憑證’，所以各地在具體執行中，計稅依據標準不一。

　　而“新文件”不僅明確規定‘鐵路貨運運費結算憑證為印花稅應稅憑證’，并且對應稅憑證的范圍做了具體的列舉。同時對作為計稅依據的運費范圍也做了比較詳細的規定。?

　　3、“新文件”在應納稅額的計算和稅款代征方面的規定，更加方便實用。
　　“新文件”相比“舊文件”有兩處改進，一是在應納稅額的計算上明確了‘稅額不足一角的免稅，超過一角的四舍五入計算到角’的規定。二是在稅款代征上增加了‘運費結算憑證不再加蓋“印花稅代扣專用章’的規定。這兩條新規定將會在很大程度上方便鐵路貨運印花稅的計算和代征工作。

　　4、“新文件”對鐵路貨運的印花稅款具體繳納方式，也做了詳細規定。
　　與‘舊文件’相比，“新文件”直接列舉出了鐵路運輸企業代征的托運方應納的印花稅與鐵路運輸企業應納的印花稅統一由各鐵路運輸企業匯總后繳入國庫的三種具體方式。

　　二、筆者認為，在稅務機關過去的鐵路貨運印花稅征管實際工作中，存在的的比較典型的問題有兩個方面，一是稅務機關過分依賴鐵路企業的計算和代征；二是由“舊文件”不嚴密的規定所帶來的問題，比如“舊文件”對計稅依據規定的過于籠統，使得各地在具體執行時，各有各的標準。

　　這也是我們在執行“新文件”時，應該注意的問題。
　　1、由于“新文件”規定，鐵路運輸企業代征的托運方應納的印花稅與鐵路運輸企業應納的印花稅統一由各鐵路運輸企業匯總后按一定的方式繳入國庫，而且鐵路企業的經營方式和核算形式行業性比較強，所以稅務機關要做好對“新文件”的輔導工作，加強對鐵路運輸企業計算和代征工作的監督和檢查力度，切不可掉以輕心。

　　2、由于鐵路企業在辦理貨運業務時，收取的費用項目比較多，比較雜，所以在掌握新舊文件異同點的基礎上，尤其要把握好“新文件”規定的鐵路貨運合同印花稅的計稅依據所包括的具體項目，長沙工商代辦，以防止多計（建設基金、貨物運輸雜費）或少計（新路均攤費、電力附加費）項目的情況發生。?